El juego de Tsuro of the Seas se parece al de Tom McMurchie Tsuro: Cada jugador tiene un barco que quiere mantener navegando, es decir, sobre el tablero, el mayor tiempo posible. Quien permanezca en el tablero más tiempo gana.

Cada turno los jugadores agregan fichas de "estela" al tablero de 7×7; cada ficha tiene dos "conexiones de estela" en cada borde, y conforme se colocan en el tablero, crean una red conectada de caminos. Si una estela se coloca frente a un barco, ese barco navega hasta el final de la estela. Si el barco sale del tablero, ese jugador queda fuera del juego.

Lo nuevo en Tsuro of the Seas son las fichas daikaiju, que representan monstruos marinos y otras criaturas del abismo. Los daikaiju pueden moverse: cada ficha tiene cinco flechas, cuatro para moverse en cada dirección cardinal y otra para rotación. En el turno del jugador activo, lanza dos dados de seis caras; con una suma de 6, 7 u 8, el daikaiju se moverá, en cualquier otra suma permanecerá quieto. Para determinar en qué dirección se mueven las fichas daikaiju, el jugador hace un segundo lanzamiento con un solo dado. Con 1-5 en el segundo lanzamiento, cada daikaiju se mueve según su flecha correspondiente. Con 6 en el segundo lanzamiento, se agrega una nueva ficha daikaiju al tablero.

Si una ficha daikaiju golpea una ficha de estela, un barco u otro daikaiju, el objeto impactado se elimina del juego. ¡Otra forma de ser eliminado! Cuantas más fichas daikaiju haya en el tablero, más rápido los jugadores se encontrarán intentando respirar bajo el agua...