Islebound: Emerald Edition es una edición especial del juego con algunos componentes y reglas alterados. Es mejor pensarla como una variante del juego, en lugar de una 2ª edición. Islebound: Emerald Edition Upgrade Pack estaba disponible para propietarios de la edición original. Las monedas de metal y los barcos de madera pintados también estaban disponibles por separado, Islebound: Emerald Edition Deluxe Components.

Esta edición de Islebound elimina el recurso libro del juego original y lo reemplaza con esmeraldas. Las esmeraldas tienen usos diferentes a los libros. Las recopila cuando visitas un pueblo propiedad de un jugador y cuando conquistas un pueblo. Las esmeraldas deben usarse para comprar cartas de construcción, y también se pueden usar para realizar habilidades especiales, ¡como mantener piratas y serpientes después del combate! El mazo de construcción se revisa para dar cuenta de este cambio de recurso. Incluye cartas de construcción alteradas tanto del juego original como de la expansión Metropolis. No habrá una expansión de cartas de construcción para Islebound: Emerald Edition, y la expansión Metropolis no es compatible con esta versión.

Los reversos de los azulejos de tripulación se pueden usar en Above and Below.