Europa, 1347. Una catástrofe está a punto de ocurrir. La Peste Negra llega a Europa, y durante los próximos 4-5 años, la población europea se reducirá a la mitad.
Los jugadores se establecen en varias regiones de Europa mientras la peste se propaga por todo el continente. Los jugadores obtienen ayuda de varias clases de la Edad Media: los Campesinos proporcionan crecimiento de población, los sabios Monjes alejan las ratas, los ricos Mercaderes huyen cuando la peste se acerca, la guerra conducida por los Caballeros propaga la peste a nuevas áreas, las Brujas controlan la propagación mediante magia y brujería, mientras que los Reyes evitan la peste permaneciendo en sus palacios fortificados. Pero la peste no hace distinciones: cuando llegan las ratas, nadie está seguro.
Cuando la peste se retira y el juego termina, el jugador con la mayor población sobreviviente gana.

Rattus es un juego de estrategia media que se desarrolla en la Edad Oscura durante la peste negra. Los jugadores intentan contener la enfermedad.
Para hacer esto reciben ayuda de campesinos, magos, caballeros, nobles... Pero nada ayuda mientras sigan llegando las ratas.